A szemek fényérzékenységének leggyakoribb szemben keresendő oka a szaruhártya-gyulladás (keratitisz). A szaruhártyában nagyon sok igen érzékeny idegvégződés található, melyek a gyulladásos folyamatokra reagálnak. Az ilyen ingerelt idegvégződéseknek kevés fény is elegendő ahhoz, hogy kioltsa a szemhéjzáró reflexet, és fájdalmat okozzon. A szaruhártya-gyulladás többnyire valamilyen szemet ért sérülés következménye, melyet idegentest, napégés vagy kórokozó, stb. okozhat. A szembe jutott idegentest ingerli a szaruhártyát, és nem csak a könnytermelést fokozza, hanem rövid időre fényérzékennyé is teszi a szemet.
Egy másik gyakori ok az akut érhártyagyulladás (hátsó uveitis), ami a szivárványhártyát (írisz) és a sugártestet (corpus ciliare) érinti. Érzékennyé válnak a szaruhártya beidegzéséről gondoskodó idegvégződések, melyek érzékelik a fényintenzitást, és a pupilla méretének változtatásával szabályozzák a beeső fény mennyiségét. Az idegek gyulladása és ingerlése szintén fotofóbiához vezet, és tompa fájdalmat okoz.

A probléma forrása lehet a szemideg (Nervus ophthalmicus) ingerlése, az arcideg (trigeminusz, azaz háromosztatú ideg) érzékenysége vagy bizonyos agyi régiókban bekövetkezett elváltozás.
Ebben az esetben a fotofóbia valamely alábbi betegség kísérő tünete lehet:
- Migrén
- Agyrázkódás
- Agyhártyagyulladás
- Veszettség
- Koponya- vagy agysérülés
- Agydaganat
Fotofóbia esetén mindenképp forduljon orvoshoz! Ez az olyan kezelést igénylő szembetegségek mihamarabbi ellátása miatt is fontos, amilyen a keratitisz vagy az uveitisz, és ha esetleg komolyabb betegség áll a háttérben, a gyógyulás esélyei jobbak, ha időben megkezdik a megfelelő kezelést.